Protein–RNA interactions for Protein: P01659

Ig kappa chain V-III region TEPC 124, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01659 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01659 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01659 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01659 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01659 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01659 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01659 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01659 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01659 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01659 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01659 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01659 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01659 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01659 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01659 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01659 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01659 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01659 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01659 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01659 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01659 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01659 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01659 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01659 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01659 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01659 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01659 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01659 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01659 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01659 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01659 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01659 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01659 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01659 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01659 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01659 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01659 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01659 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01659 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01659 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01659 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01659 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01659 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01659 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01659 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01659 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01659 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01659 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01659 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01659 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01659 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01659 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01659 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01659 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01659 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01659 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01659 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01659 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01659 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01659 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01659 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01659 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01659 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01659 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01659 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01659 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01659 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01659 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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P01659 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01659 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01659 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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P01659 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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P01659 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01659 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01659 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01659 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01659 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01659 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01659 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01659 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01659 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01659 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01659 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01659 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01659 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01659 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01659 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01659 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01659 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01659 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01659 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01659 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01659 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01659 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01659 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01659 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01659 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms