Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P01641 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P01641 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P01641 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01641 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P01641 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01641 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01641 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01641 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01641 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01641 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01641 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01641 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01641 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01641 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01641 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01641 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01641 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01641 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P01641 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01641 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01641 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01641 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01641 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01641 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01641 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01641 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01641 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01641 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01641 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01641 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01641 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01641 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01641 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P01641 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01641 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01641 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01641 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01641 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01641 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01641 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P01641 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P01641 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01641 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01641 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01641 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01641 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01641 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01641 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01641 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01641 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01641 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01641 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01641 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01641 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01641 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01641 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01641 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01641 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01641 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01641 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01641 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01641 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01641 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01641 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01641 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01641 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01641 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01641 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01641 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P01641 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01641 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01641 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01641 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01641 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01641 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01641 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01641 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01641 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01641 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01641 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01641 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01641 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01641 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01641 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01641 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01641 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01641 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01641 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01641 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01641 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01641 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01641 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01641 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01641 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01641 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01641 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01641 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01641 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01641 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms