Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChkaO54804 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChkaO54804 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChkaO54804 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChkaO54804 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChkaO54804 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChkaO54804 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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