Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DffaO54786 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DffaO54786 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DffaO54786 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DffaO54786 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
DffaO54786 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DffaO54786 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DffaO54786 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
DffaO54786 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DffaO54786 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DffaO54786 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DffaO54786 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DffaO54786 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DffaO54786 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DffaO54786 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
DffaO54786 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DffaO54786 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DffaO54786 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DffaO54786 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
DffaO54786 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DffaO54786 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DffaO54786 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DffaO54786 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DffaO54786 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
DffaO54786 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DffaO54786 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DffaO54786 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DffaO54786 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DffaO54786 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DffaO54786 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DffaO54786 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DffaO54786 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DffaO54786 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DffaO54786 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DffaO54786 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DffaO54786 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DffaO54786 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DffaO54786 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DffaO54786 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DffaO54786 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DffaO54786 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DffaO54786 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DffaO54786 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DffaO54786 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
DffaO54786 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DffaO54786 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
DffaO54786 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
DffaO54786 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DffaO54786 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DffaO54786 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DffaO54786 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DffaO54786 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DffaO54786 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DffaO54786 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DffaO54786 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DffaO54786 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DffaO54786 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DffaO54786 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DffaO54786 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DffaO54786 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DffaO54786 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DffaO54786 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DffaO54786 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DffaO54786 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DffaO54786 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DffaO54786 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DffaO54786 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DffaO54786 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DffaO54786 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DffaO54786 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DffaO54786 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DffaO54786 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DffaO54786 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
DffaO54786 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
DffaO54786 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DffaO54786 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DffaO54786 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DffaO54786 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DffaO54786 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DffaO54786 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DffaO54786 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DffaO54786 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
DffaO54786 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DffaO54786 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DffaO54786 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
DffaO54786 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DffaO54786 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DffaO54786 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
DffaO54786 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DffaO54786 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DffaO54786 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DffaO54786 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DffaO54786 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DffaO54786 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DffaO54786 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DffaO54786 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DffaO54786 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DffaO54786 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DffaO54786 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DffaO54786 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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