Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaxO35602 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaxO35602 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RaxO35602 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RaxO35602 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RaxO35602 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RaxO35602 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaxO35602 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaxO35602 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaxO35602 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaxO35602 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaxO35602 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaxO35602 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaxO35602 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaxO35602 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaxO35602 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaxO35602 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaxO35602 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaxO35602 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaxO35602 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaxO35602 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaxO35602 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaxO35602 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaxO35602 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RaxO35602 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaxO35602 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaxO35602 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaxO35602 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RaxO35602 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RaxO35602 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RaxO35602 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
RaxO35602 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RaxO35602 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RaxO35602 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RaxO35602 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaxO35602 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaxO35602 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaxO35602 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaxO35602 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaxO35602 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaxO35602 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaxO35602 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaxO35602 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaxO35602 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaxO35602 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaxO35602 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaxO35602 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaxO35602 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaxO35602 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaxO35602 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RaxO35602 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaxO35602 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaxO35602 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaxO35602 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaxO35602 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaxO35602 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaxO35602 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaxO35602 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaxO35602 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaxO35602 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaxO35602 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaxO35602 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaxO35602 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaxO35602 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaxO35602 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaxO35602 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaxO35602 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaxO35602 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaxO35602 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaxO35602 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaxO35602 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaxO35602 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaxO35602 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaxO35602 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaxO35602 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaxO35602 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RaxO35602 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RaxO35602 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RaxO35602 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RaxO35602 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RaxO35602 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RaxO35602 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RaxO35602 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RaxO35602 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RaxO35602 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RaxO35602 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RaxO35602 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RaxO35602 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RaxO35602 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RaxO35602 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RaxO35602 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RaxO35602 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RaxO35602 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RaxO35602 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RaxO35602 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RaxO35602 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RaxO35602 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RaxO35602 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RaxO35602 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RaxO35602 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms