Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

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Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ColqO35348 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ColqO35348 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ColqO35348 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ColqO35348 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ColqO35348 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ColqO35348 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ColqO35348 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ColqO35348 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ColqO35348 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ColqO35348 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ColqO35348 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ColqO35348 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ColqO35348 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ColqO35348 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ColqO35348 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ColqO35348 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ColqO35348 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ColqO35348 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ColqO35348 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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ColqO35348 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ColqO35348 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ColqO35348 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ColqO35348 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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ColqO35348 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ColqO35348 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ColqO35348 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ColqO35348 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ColqO35348 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ColqO35348 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ColqO35348 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ColqO35348 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ColqO35348 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ColqO35348 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ColqO35348 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ColqO35348 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ColqO35348 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ColqO35348 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ColqO35348 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
ColqO35348 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
ColqO35348 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
ColqO35348 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
ColqO35348 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ColqO35348 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ColqO35348 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ColqO35348 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ColqO35348 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ColqO35348 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ColqO35348 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ColqO35348 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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ColqO35348 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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ColqO35348 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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ColqO35348 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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ColqO35348 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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ColqO35348 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ColqO35348 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ColqO35348 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ColqO35348 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ColqO35348 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ColqO35348 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ColqO35348 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ColqO35348 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ColqO35348 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ColqO35348 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ColqO35348 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ColqO35348 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ColqO35348 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ColqO35348 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ColqO35348 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ColqO35348 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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