Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Smad6O35182 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smad6O35182 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smad6O35182 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smad6O35182 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smad6O35182 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smad6O35182 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smad6O35182 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smad6O35182 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms