Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ArxO35085 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ArxO35085 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ArxO35085 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ArxO35085 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ArxO35085 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ArxO35085 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ArxO35085 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ArxO35085 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ArxO35085 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ArxO35085 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ArxO35085 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ArxO35085 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ArxO35085 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ArxO35085 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ArxO35085 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ArxO35085 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ArxO35085 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ArxO35085 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ArxO35085 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ArxO35085 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ArxO35085 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ArxO35085 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ArxO35085 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ArxO35085 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ArxO35085 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ArxO35085 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ArxO35085 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ArxO35085 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ArxO35085 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ArxO35085 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ArxO35085 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ArxO35085 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ArxO35085 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ArxO35085 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ArxO35085 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ArxO35085 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ArxO35085 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ArxO35085 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ArxO35085 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ArxO35085 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ArxO35085 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ArxO35085 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ArxO35085 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ArxO35085 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ArxO35085 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ArxO35085 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ArxO35085 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ArxO35085 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ArxO35085 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ArxO35085 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ArxO35085 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ArxO35085 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ArxO35085 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ArxO35085 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ArxO35085 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ArxO35085 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ArxO35085 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms