Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MttpO08601 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MttpO08601 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MttpO08601 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MttpO08601 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MttpO08601 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MttpO08601 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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MttpO08601 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MttpO08601 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MttpO08601 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MttpO08601 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
MttpO08601 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MttpO08601 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MttpO08601 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MttpO08601 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MttpO08601 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MttpO08601 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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MttpO08601 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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MttpO08601 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MttpO08601 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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MttpO08601 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MttpO08601 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MttpO08601 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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MttpO08601 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MttpO08601 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MttpO08601 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MttpO08601 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MttpO08601 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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MttpO08601 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MttpO08601 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MttpO08601 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
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MttpO08601 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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MttpO08601 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MttpO08601 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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MttpO08601 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MttpO08601 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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MttpO08601 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MttpO08601 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MttpO08601 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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MttpO08601 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MttpO08601 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MttpO08601 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MttpO08601 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MttpO08601 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MttpO08601 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MttpO08601 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MttpO08601 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MttpO08601 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MttpO08601 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
MttpO08601 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MttpO08601 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MttpO08601 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MttpO08601 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MttpO08601 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MttpO08601 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MttpO08601 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MttpO08601 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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MttpO08601 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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