Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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