Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Usp35M0QWN7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usp35M0QWN7 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usp35M0QWN7 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usp35M0QWN7 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usp35M0QWN7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usp35M0QWN7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Usp35M0QWN7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Usp35M0QWN7 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Usp35M0QWN7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Usp35M0QWN7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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