Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms