Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms