Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21976J3QNN2 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms