Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms