Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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