Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Taf4bG5E8Z2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms