Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Gm16552-201ENSMUST00000162348 685 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Gm42794-201ENSMUST00000197636 835 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Gm12586-201ENSMUST00000117328 1316 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Milr1-201ENSMUST00000086353 1348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 AC132833.1-202ENSMUST00000228875 1690 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 AC124675.1-201ENSMUST00000226263 1390 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Gm14692-201ENSMUST00000114672 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Gm1140-201ENSMUST00000114675 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Gm12460-201ENSMUST00000117147 357 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Nkx1-1G3UXB3 Gm28448-201ENSMUST00000188547 428 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 AC153526.1-201ENSMUST00000219750 190 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Lilrb4a-215ENSMUST00000220182 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Olfr780-201ENSMUST00000063168 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Nkx1-1G3UXB3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Nkx1-1G3UXB3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Gm6680-201ENSMUST00000192789 950 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 9430099M06Rik-201ENSMUST00000210409 742 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Gm18160-201ENSMUST00000214279 827 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx1-1G3UXB3 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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