Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Tmem56-207ENSMUST00000155309 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms