Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pagr1bF6V0H0 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1bF6V0H0 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms