Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ8

E430018J23Rik, RIKEN cDNA E430018J23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E430018J23RikE9PZQ8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms