Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsf1E9PWW9 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms