Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms