Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SafbD3YXK2 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms