Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms