Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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