Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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