Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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