Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms