Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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