Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GabreA2AMW3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GabreA2AMW3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GabreA2AMW3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GabreA2AMW3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GabreA2AMW3 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
GabreA2AMW3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GabreA2AMW3 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GabreA2AMW3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GabreA2AMW3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GabreA2AMW3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GabreA2AMW3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GabreA2AMW3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GabreA2AMW3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GabreA2AMW3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GabreA2AMW3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GabreA2AMW3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GabreA2AMW3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GabreA2AMW3 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GabreA2AMW3 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GabreA2AMW3 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GabreA2AMW3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GabreA2AMW3 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GabreA2AMW3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GabreA2AMW3 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GabreA2AMW3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GabreA2AMW3 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GabreA2AMW3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms