Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Lcn6A2AJB9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Lcn6A2AJB9 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Lcn6A2AJB9 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lcn6A2AJB9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms