Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms