Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Rnf4Q9QZS2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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