Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms