Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsmQ9JL96 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms