Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms