Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ldb3Q9JKS4 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms