Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms