Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms