Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms