Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Etaa1os-202ENSMUST00000148496 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gm28514-201ENSMUST00000187488 450 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 AC107711.1-201ENSMUST00000227258 1295 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Olfr533-201ENSMUST00000071755 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 A530006G24Rik-201ENSMUST00000152542 1331 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gm11480-201ENSMUST00000120214 659 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gm18303-201ENSMUST00000190055 1176 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gm43992-201ENSMUST00000204358 197 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 9430099M06Rik-201ENSMUST00000210409 742 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gm18160-201ENSMUST00000214279 827 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gm7588-201ENSMUST00000216866 571 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 AC164297.5-201ENSMUST00000224365 198 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 AC080021.1-201ENSMUST00000228104 700 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Enkur-201ENSMUST00000027992 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gm42435-201ENSMUST00000196630 1448 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gm26069-201ENSMUST00000157497 277 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms