Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Smg9Q9DB90 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Smg9Q9DB90 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Smg9Q9DB90 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Smg9Q9DB90 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
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