Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ift43Q9DA69 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms