Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D1

Rnf225, RING finger protein 225, mousemouse

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Length 332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf225Q9D7D1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Olfr1032-203ENSMUST00000111589 1393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 1700016H13Rik-202ENSMUST00000119824 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Olfr1124-201ENSMUST00000062494 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf225Q9D7D1 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf225Q9D7D1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf225Q9D7D1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rnf225Q9D7D1 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf225Q9D7D1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rnf225Q9D7D1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rnf225Q9D7D1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rnf225Q9D7D1 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rnf225Q9D7D1 Higd1a-202ENSMUST00000213124 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf225Q9D7D1 Gm40646-201ENSMUST00000218243 490 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf225Q9D7D1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf225Q9D7D1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf225Q9D7D1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf225Q9D7D1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf225Q9D7D1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf225Q9D7D1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf225Q9D7D1 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf225Q9D7D1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf225Q9D7D1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf225Q9D7D1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf225Q9D7D1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf225Q9D7D1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf225Q9D7D1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf225Q9D7D1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf225Q9D7D1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf225Q9D7D1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf225Q9D7D1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf225Q9D7D1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf225Q9D7D1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf225Q9D7D1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf225Q9D7D1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf225Q9D7D1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf225Q9D7D1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf225Q9D7D1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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