Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms