Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms