Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5L7

Spsb1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb1Q9D5L7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spsb1Q9D5L7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms