Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms