Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UvssaQ9D479 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
UvssaQ9D479 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
UvssaQ9D479 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
UvssaQ9D479 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UvssaQ9D479 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UvssaQ9D479 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UvssaQ9D479 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UvssaQ9D479 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UvssaQ9D479 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms